
发明创造名称:使用质谱检测至少一种头孢菌素抗性机制的方法
外观设计名称:
决定号:188225
决定日:2019-08-27
委内编号:1F233010
优先权日:2011-04-21
申请(专利)号:201280030176.0
申请日:2012-04-20
复审请求人:生物梅里埃公司
无效请求人:
授权公告日:
审定公告日:
专利权人:
主审员:周洋
合议组组长:幸颖
参审员:赵彦豪
国际分类号:C12Q1/04,G01N33/68
外观设计分类号:
法律依据:专利法第22条第3款、专利法第31条第1款
决定要点:评价一项发明是否具备创造性时,应将其与最接近的现有技术比较以确定区别特征和实际解决的技术问题,然后考察现有技术整体上是否给出了将上述区别特征应用到该最接近的现有技术以解决其存在的技术问题的启示,如果现有技术中存在这种启示,则该发明是显而易见的,不具备创造性。
全文:
本复审请求涉及申请号为201280030176.0,名称为“使用质谱检测至少一种头孢菌素抗性机制的方法”的发明专利申请。申请人为生物梅里埃公司。本申请的申请日为2012年04月20日,优先权日为2011年04月21日,公开日为2014年04月23日。
经实质审查,国家知识产权局原审查部门于2017年06月08日发出驳回决定,以本申请权利要求1-9不具备创造性,权利要求1-36各技术方案之间不具备单一性为由,驳回了本发明专利申请。驳回决定所依据的文本为:2013年12月19日提交的说明书第1-2536段、说明书摘要;以及2015年10月15日提交的权利要求第1-36项。驳回决定所针对的权利要求书如下:
“1. 一种通过多反应监测模式的串联质谱类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于: a)抗菌剂是头孢菌素;以及 b)所述抗性标记是蛋白质或肽。
2. 权利要求1的检测方法,其中所述抗性标记是来源于所述至少一种微生物的蛋白质。
3. 权利要求2的检测方法,其中来源于所述微生物的蛋白质被消化成肽。
4. 权利要求3的检测方法,其中用酶进行所述消化。
5. 权利要求4的检测方法,其中所述酶是胰蛋白酶。
6. 权利要求1-5中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是TEM、CMY、CTX-M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA或GES中的蛋白或肽。
7. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.166到SEQ ID No.218、SEQ ID No.220到SEQ ID No.230、SEQ ID No.232到SEQ ID No.241、SEQ ID No.243到SEQ ID No.252、SEQ ID No.254到SEQ ID No.257、SEQ ID No.259到SEQ ID No.261、SEQ ID No.1923、SEQ ID No.1927和SEQ ID No.1928的肽的TEM肽。
8. 权利要求7的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.166、SEQ ID No.167、SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.170、SEQ ID No.171、SEQ ID No.172、SEQ ID No.173、SEQ ID No.174、SEQ ID No.180、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.187、SEQ ID No.188、SEQ ID No.189、SEQ ID No.190、SEQ ID No.191、SEQ ID No.192、SEQ ID No.193、SEQ ID No.194、SEQ ID No.195、SEQ ID No.196、SEQ ID No.197、SEQ ID No.198、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.201、SEQ ID No.202、SEQ ID No.203、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.219、SEQ ID No.220、SEQ ID No.223、SEQ ID No.224、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.228、SEQ ID No.229、SEQ ID No.230、SEQ ID No.241、SEQ ID No.242、SEQ ID No.243、SEQ ID No.250、SEQ ID No.251、SEQ ID No.252、SEQ ID No.253、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.259、SEQ ID No.260、SEQ ID No.261、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928的肽的TEM标记。
9. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性是ESBL,所述抗性标记肽选自序列SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.179、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.205、SEQ ID No.206、SEQ ID No.208、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.222、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.230、SEQ ID No.234、SEQ ID No.236、SEQ ID No.237、SEQ ID No.238、SEQ ID No.239、SEQ ID No.240、SEQ ID No.249、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.256、SEQ ID No.259、SEQ ID No.261、SEQ ID No.446、SEQ ID No.447、SEQ ID No.448、SEQ ID No.449、SEQ ID No.450、SEQ ID No.451、SEQ ID No.452、SEQ ID No.453、SEQ ID No.454、SEQ ID No.455、SEQ ID No.456、SEQ ID No.457、SEQ ID No.458、SEQ ID No.459、SEQ ID No.460、SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.465、SEQ ID No.466、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.469、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.472、SEQ ID No.473、SEQ ID No.474、SEQ ID No.475、SEQ ID No.476、SEQ ID No.477、SEQ ID No.478、SEQ ID No.480、SEQ ID No.481、SEQ ID No.482、SEQ ID No.483、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.486、SEQ ID No.487、SEQ ID No.488、SEQ ID No.489、SEQ ID No.490、SEQ ID No.491、SEQ ID No.492、SEQ ID No.493、SEQ ID No.494、SEQ ID No.495、SEQ ID No.615、SEQ ID No.634、SEQ ID No.646、SEQ ID No.651、SEQ ID No.659、SEQ ID No.663、SEQ ID No.665、SEQ ID No.678、SEQ ID No.683、SEQ ID No.686、SEQ ID No.690、SEQ ID No.702、SEQ ID No.705、SEQ ID No.1045、SEQ ID No.1046、SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1052、SEQ ID No.1053、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1056、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1058、SEQ ID No.1059、SEQ ID No.1060、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1062、SEQ ID No.1063、SEQ ID No.1064、SEQ ID No.1065、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1070、SEQ ID No.1071、SEQ ID No.1072、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1074、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076、SEQ ID No.1077、SEQ ID No.1085、SEQ ID No.1086、SEQ ID No.1087、SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1090、SEQ ID No.1091、SEQ ID No.1092、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1094、SEQ ID No.1095、SEQ ID No.1096、SEQ ID No.1097、SEQ ID No.1098、SEQ ID No.1099、SEQ ID No.1100、SEQ ID No.1101、SEQ ID No.1102、SEQ ID No.1103、SEQ ID No.1104、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928、SEQ ID No.2009、SEQ ID No.2010、SEQ ID No.2011、SEQ ID No.2012、SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092、SEQ ID No.2095、SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134、SEQ ID No.2135、SEQ ID No.2136、SEQ ID No.2137、SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141、SEQ ID No.2142、SEQ ID No.2143、SEQ ID No.2144、SEQ ID No.2145、SEQ ID No.2146、SEQ ID No.2147、SEQ ID No.2148、SEQ ID No.2149、SEQ ID No.2150、SEQ ID No.2151、SEQ ID No.2152、SEQ ID No.2153、SEQ ID No.2154、SEQ ID No.2155、SEQ ID No.2157、SEQ ID No.2158、SEQ ID No.2159、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171。
10. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.312到SEQ ID No.320、SEQ ID No.322到SEQ ID No.343、SEQ ID No.345到SEQ ID No.350、SEQ ID No.1929、SEQ ID No.1931到SEQ ID No.1934、SEQ ID No.1936、SEQ ID No.1938、SEQ ID No.1939、SEQ ID No.1940、SEQ ID No.1942、SEQ ID No.1944、SEQ ID No.1945、SEQ ID No.1946、SEQ ID No.1948、SEQ ID No.1949、SEQ ID No.1951、SEQ ID No.1953到SEQ ID No.1962、SEQ ID No.1969、SEQ ID No.1970、SEQ ID No.1971、SEQ ID No.1978、SEQ ID No.1980、SEQ ID No.1981、SEQ ID No.1982、SEQ ID No.1984到SEQ ID No.1999、SEQ ID No.2001、SEQ ID No.2002、SEQ ID No.2003、SEQ ID No.2004、SEQ ID No.2007的肽的CMY肽。
11. 权利要求10的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.312、SEQ ID No.313、SEQ ID No.314、SEQ ID No.315、SEQ ID No.316、SEQ ID No.317、SEQ ID No.318、SEQ ID No.320、SEQ ID No.322、SEQ ID No.323、SEQ ID No.325、SEQ ID No.326、SEQ ID No.327、SEQ ID No.328、SEQ ID No.330、SEQ ID No.331、SEQ ID No.332、SEQ ID No.333、SEQ ID No.334、SEQ ID No.335、SEQ ID No.336、SEQ ID No.339、SEQ ID No.340、SEQ ID No.350、SEQ ID No.337、SEQ ID No.343的肽的CMY肽。
12. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.446到SEQ ID No.478、SEQ ID No.480到SEQ ID No.495和SEQ ID No.2009到SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092的肽的CTX-M肽。
13. 权利要求12的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.446、SEQ ID No.451、SEQ ID No.454、SEQ ID No.458、SEQ ID No.460、 SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.474、SEQ ID No.480、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.489、SEQ ID No.491的肽的CTX-M肽。
14. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.614到SEQ ID No.711和SEQ ID No.2093到SEQ ID No.2096的肽的SHV肽。
15. 权利要求12的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.614、SEQ ID No.617、SEQ ID No.618、SEQ ID No.619、SEQ ID No.620、SEQ ID No.622、SEQ ID No.624、SEQ ID No.626、SEQ ID No.628、SEQ ID No.630、SEQ ID No.631、SEQ ID No.632、SEQ ID No.636、SEQ ID No.637、SEQ ID No.638、SEQ ID No.649、SEQ ID No.651、SEQ ID No.652、SEQ ID No.653、SEQ ID No.655、SEQ ID No.656、SEQ ID No.657、SEQ ID No.658、SEQ ID No.659、SEQ ID No.660、SEQ ID No.661、SEQ ID No.662、SEQ ID No.663、SEQ ID No.664、SEQ ID No.666、SEQ ID No.667、SEQ ID No.668、SEQ ID No.671、SEQ ID No.672、SEQ ID No.674、SEQ ID No.682、SEQ ID No.684、SEQ ID No.686、SEQ ID No.689、SEQ ID No.691、SEQ ID No.694、SEQ ID No.695、SEQ ID No.696、SEQ ID No.697、SEQ ID No.698、SEQ ID No.701、SEQ ID No.702、SEQ ID No.704、SEQ ID No.707、SEQ ID No.708的肽的SHV肽。
16. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.719到SEQ ID No.733、SEQ ID No.2098、SEQ ID No.2101、SEQ ID No.2102、SEQ ID No.2105、SEQ ID No.2107、SEQ ID No.2108、SEQ ID No.2109、SEQ ID No.2110、SEQ ID No.2112和SEQ ID No.2113的肽的FOX肽。
17. 权利要求16的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.719、SEQ ID No.720、SEQ ID No.721、SEQ ID No.723、SEQ ID No.724、SEQ ID No.725、SEQ ID No.726、SEQ ID No.727、SEQ ID No.728、SEQ ID No.729、SEQ ID No.730、SEQ ID No.731、SEQ ID No.732的肽的FOX肽。
18. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.740到SEQ ID No.787的肽的ACC肽。
19. 权利要求18的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.740、SEQ ID No.741、SEQ ID No.742、SEQ ID No.743、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.746、SEQ ID No.747、SEQ ID No.748、SEQ ID No.751、SEQ ID No.755、SEQ ID No.756、SEQ ID No.757、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.762、SEQ ID No.763、SEQ ID No.765、SEQ ID No.766、SEQ ID No.767、SEQ ID No.768、SEQ ID No.769、SEQ ID No.770、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.774、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.777、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.780、SEQ ID No.781、SEQ ID No.782、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.785、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的ACC肽。
20. 权利要求18的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.741、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.756、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.765、SEQ ID No.767、SEQ ID No.769、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.781、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的ACC肽。
21. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.798、SEQ ID No.799、SEQ ID No.802、SEQ ID No.804到SEQ ID No.807、SEQ ID No.809到SEQ ID No.813、SEQ ID No.816到SEQ ID No.826、SEQ ID No.828到SEQ ID No.841的肽的ACT肽。
22. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.853到SEQ ID No.921的肽的CARB肽。
23. 权利要求22的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.853、SEQ ID No.854、SEQ ID No.855、SEQ ID No.856、SEQ ID No.857、SEQ ID No.859、SEQ ID No.860、SEQ ID No.861、SEQ ID No.865、SEQ ID No.866、SEQ ID No.867、SEQ ID No.868、SEQ ID No.869、SEQ ID No.870、SEQ ID No.871、SEQ ID No.872、SEQ ID No.873、SEQ ID No.874、SEQ ID No.875、SEQ ID No.876、SEQ ID No.877、SEQ ID No.878、SEQ ID No.882、SEQ ID No.883、SEQ ID No.884、SEQ ID No.886、SEQ ID No.887、SEQ ID No.889、SEQ ID No.890、SEQ ID No.891、SEQ ID No.892、SEQ ID No.893、SEQ ID No.894、SEQ ID No.896、SEQ ID No.897、SEQ ID No.898、SEQ ID No.899、SEQ ID No.900、SEQ ID No.901、SEQ ID No.903、SEQ ID No.904、SEQ ID No.905、SEQ ID No.906、SEQ ID No.907、SEQ ID No.908、SEQ ID No.909、SEQ ID No.911、SEQ ID No.912、SEQ ID No.913、SEQ ID No.915、SEQ ID No.916、SEQ ID No.917、SEQ ID No.918、SEQ ID No.919、SEQ ID No.920、SEQ ID No.921的肽的CARB肽。
24. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.928到SEQ ID No.935、SEQ ID No.937到SEQ ID No.942、SEQ ID No.944到SEQ ID No.948的肽的DHA肽。
25. 权利要求24的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.929、SEQ ID No.931、SEQ ID No.932、SEQ ID No.934、SEQ ID No.937、SEQ ID No.938、SEQ ID No.939、SEQ ID No.941、SEQ ID No.944、SEQ ID No.946、SEQ ID No.947、SEQ ID No.948的肽的DHA肽。
26. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.954、SEQ ID No.956、SEQ ID No.957、SEQ ID No.959到SEQ ID No.961、SEQ ID No.963、SEQ ID No.964、SEQ ID No.966、SEQ ID No.967、SEQ ID No.969到SEQ ID No.981的肽的MIR肽。
27. 权利要求26的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.979、SEQ ID No.980、SEQ ID No.981的肽的MIR肽。
28. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.990到SEQ ID No.993、SEQ ID No.995到SEQ ID No.998、SEQ ID No.1000到SEQ ID No.1012、SEQ ID No.1014到SEQ ID No.1016、SEQ ID No.1018到SEQ ID No.1020、SEQ ID No.1022到SEQ ID No.1029和SEQ ID No.1031到SEQ ID No.1037的肽的MOX肽。
29. 权利要求28的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.992、SEQ ID No.1015、SEQ ID No.1006、SEQ ID No.1023、SEQ ID No.1024、SEQ ID No.1035、SEQ ID No.1036、SEQ ID No.1037的肽的MOX肽。
30. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.1045到SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051到SEQ ID No.1065和SEQ ID No.1069到SEQ ID No.1077的肽的PER肽。
31. 权利要求30的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076的肽的PER肽。
32. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.1085到SEQ ID No.1104的肽的VEB肽。
33. 权利要求32的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1103的肽的VEB肽。
34. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.1267、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1273、SEQ ID No.1274、SEQ ID No.1275、SEQ ID No.1276、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1284、SEQ ID No.1286、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1289、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1291、SEQ ID No.1292、SEQ ID No.1293、SEQ ID No.1294、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1296、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1298、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1311、SEQ ID No.1312、SEQ ID No.1313、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1321、SEQ ID No.1322、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1324、SEQ ID No.1325、SEQ ID No.1329、SEQ ID No.1330、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1333、SEQ ID No.1334、SEQ ID No.1335、SEQ ID No.1336、SEQ ID No.1338、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1345、SEQ ID No.1346、SEQ ID No.1347、SEQ ID No.1348、SEQ ID No.1349、SEQ ID No.1351、SEQ ID No.1352、SEQ ID No.1353、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1362、SEQ ID No.1364、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1370、SEQ ID No.1371、SEQ ID No.1372、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1374、SEQ ID No.1376、SEQ ID No.1378、SEQ ID No.1380、SEQ ID No.1381、SEQ ID No.1382、SEQ ID No.1383、SEQ ID No.1384、SEQ ID No.1385、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1395、SEQ ID No.1396、SEQ ID No.1397、SEQ ID No.1398、SEQ ID No.1399、SEQ ID No.1400、SEQ ID No.1401、SEQ ID No.1403、SEQ ID No.1406、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1409、SEQ ID No.1410、SEQ ID No.1411、SEQ ID No.1412、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1417、SEQ ID No.1418、SEQ ID No.1422、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1424、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1428、SEQ ID No.1430、SEQ ID No.1431、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1434、SEQ ID No.1435、SEQ ID No.1436、SEQ ID No.1437、SEQ ID No.1438、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1443、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1445、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1449、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1452、SEQ ID No.1454、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1458、SEQ ID No.1459、SEQ ID No.1460、SEQ ID No.1461、SEQ ID No.1464、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1475、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1483、SEQ ID No.1484、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1486、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1493、SEQ ID No.1494、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1496、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1501、SEQ ID No.1502、SEQ ID No.1503、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1505、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1507、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1511、SEQ ID No.1512、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1517、SEQ ID No.1518、SEQ ID No.1520、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1524、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1527、SEQ ID No.1528、SEQ ID No.1529、SEQ ID No.1531、SEQ ID No.1532、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1535、SEQ ID No.1536、SEQ ID No.1537、SEQ ID No.1538、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1541、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1544、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1546、SEQ ID No.1547、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1557、SEQ ID No.1558、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1561、SEQ ID No.1562、SEQ ID No.1563、SEQ ID No.1564、SEQ ID No.1565、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1568、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1573、SEQ ID No.1576、SEQ ID No.1579、SEQ ID No.1580、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1583、SEQ ID No.1584、SEQ ID No.1585、SEQ ID No.1586、SEQ ID No.1587、SEQ ID No.1588、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1591、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1593、SEQ ID No.1594、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1599、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1603、SEQ ID No.1604、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1606、SEQ ID No.1607、SEQ ID No.1608、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1619、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1623、SEQ ID No.1624、SEQ ID No.1625、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1629、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1636、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1641、SEQ ID No.1642、SEQ ID No.1643、SEQ ID No.1644、SEQ ID No.1645、SEQ ID No.1646、SEQ ID No.1647、SEQ ID No.1648、SEQ ID No.1649、SEQ ID No.1650、SEQ ID No.1651、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1654、SEQ ID No.1655、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1658、SEQ ID No.1659、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1663、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1667、SEQ ID No.1668、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1679、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1686、SEQ ID No.1688、SEQ ID No.1690、SEQ ID No.1693、SEQ ID No.1694、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1698、SEQ ID No.1699、SEQ ID No.1700、SEQ ID No.1701、SEQ ID No.1702、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1705、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1711、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1716、SEQ ID No.1719、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1726、SEQ ID No.1728、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1731、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1734、SEQ ID No.1735、SEQ ID No.1736、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1739、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1741、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1744、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1750、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1756、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1766、SEQ ID No.1767、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1770、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1772、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1778、SEQ ID No.1780、SEQ ID No.1782、SEQ ID No.1783、SEQ ID No.1784、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1786、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1789、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1799、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1802、SEQ ID No.1803、SEQ ID No.1804、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1807、SEQ ID No.1808、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1811、SEQ ID No.1812、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1817、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1820、SEQ ID No.1821、SEQ ID No.1822、SEQ ID No.1825、SEQ ID No.1826、SEQ ID No.1827、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1829、SEQ ID No.1830、SEQ ID No.1831、SEQ ID No.1832、SEQ ID No.1833、SEQ ID No.1834、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽的OXA肽。
35. 权利要求34的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽的OXA肽。
36. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134到SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141到SEQ ID No.2155和SEQ ID No.2157到SEQ ID No.2159的肽的GES肽。 ”
驳回决定认为:(一)关于单一性。权利要求1-36涉及16组技术方案,其中第1组(权利要求7、8(全部)、1-6、9(部分))是针对TEM类β-内酰胺酶的抗性标记多肽的相关检测方法,第2-15组(权利要求1-36(部分))是针对CMY、CTX-M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA或GES类β-内酰胺酶的抗性标记多肽的相关检测方法,第16组(权利要求1-5(部分))是针对非β-内酰胺酶的抗性标记多肽的相关检测方法。以上16组技术方案之间的附加技术特征是:均涉及一种通过多反应监测模式的串联质谱检测样品中针对抗性标记检测微生物的方法。对比文件1(I.WYBO ET AL, Differentiation of cfiA-Negative and cfiA-Positive Bacteroids fragilis Isolated by Matrix-Assited Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry, Journal of Clinical MICROBIOLOGY, vol.49,No.5,公开日:2011年02月23日)公开了一种利用质谱检测样品中碳青霉烯抗性微生物的检测方法,其中涉及了cfiA基因编码的β-内酰胺酶的检测,通过检测cfiA基因的存在预测碳青霉烯抗性;而对比文件2(Keshishian et al, Quantitative,Multiplexed Assays for Low Abundance Proteins in Plasma by Targeted Mass Spectrometry and Stable Isotope Dilution, Molecular & Cellular Proteomics, 2007, Vol.6, No.12, pages 2212-2229, 公开日:2007年12月31日)公开了一种多反应监测模式的串联质谱类型的质谱与SID-MS方法联合检测微生物样品中的特定蛋白,因此,上述权利要求涉及的技术方案在技术上互不关联,没有相同或相应的特定技术特征,因而不具备单一性。(二)关于创造性。对比文件1公开了一种利用质谱检测样品中脆弱拟杆菌针对碳青霉烯抗性的,以cfiA基因编码蛋白为抗性标记方法,并公开了相关步骤。权利要求1与对比文件1的区别在于:(1)对比文件1涉及的抗菌剂不是头孢菌素;(2)对比文件1没有公开使用多反应监测模式的串联质谱。本领域技术人员根据区别技术特征确定本申请所要解决的技术问题是:获得另一种使用质谱检测头孢菌素抗性机制的方法。针对区别特征(1),本领域技术人员能够知晓:头孢菌素和碳青霉烯均为β-内酰胺酶(cfiA基因编码其中一种)类抗生素,cfiA编码的金属类β-内酰胺酶是对广谱头孢菌素耐药的原因之一,对于本领域技术人员而言,在对比文件1公开内容的基础上,本领域技术人员有动机针对头孢菌素进行耐药性检测,以获得相关检测方法。针对区别特征(2),对比文件2公开了一种多反应监测模式的串联质谱类型的质谱与SID-MS方法联合检测微生物样品中的特定低丰度蛋白的方法,并公开了具体的步骤以及流程,通过实验证实了这种联合方法能够有效的检测目标蛋白,并进一步公开了相关蛋白样品被胰蛋白酶消化成肽。由此可见,对比文件2已经给出了使用多反应监测模式的串联质谱检测目标蛋白的技术启示,在此基础上,本领域技术人员为了更有效的检测目标蛋白,有动机在对比文件1公开内容的基础上结合对比文件2,获得权利要求1请求保护的技术方案,因此权利要求1不具备创造性。基于相同或相似的理由,权利要求2-5也均不具备创造性。权利要求6-9直接或间接引用前述的权利要求,并限定了具体的抗性标记。根据前面的评述可知:一种通过多反应监测模式的串联质谱类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法是不具有创造性的,在此基础上,本领域技术人员很容易想到根据自己的研究需求,选择合适抗性标记进行相关研究,因此权利要求6-9也均不具备创造性。
申请人(下称复审请求人)对上述驳回决定不服,于2017年09月22日向国家知识产权局提出了复审请求,同时修改了权利要求书和说明书,将权利要求1中的“串联质谱”修改为“MS/MS”并限定了所述抗性标记 “包括TEM蛋白质或肽”,对说明书中删除了冗余表述“(MS/MS spectrometry)”,并且对权利要求书进行了适应性修改。复审请求时新修改的权利要求书如下:
“1. 一种通过多反应监测模式的MS/MS类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于: a)抗菌剂是头孢菌素;以及 b)所述抗性标记包括TEM蛋白质或肽。
2. 权利要求1的检测方法,其中所述抗性标记是来源于所述至少一种微生物的蛋白质。
3. 权利要求2的检测方法,其中来源于所述微生物的蛋白质被消化成肽。
4. 权利要求3的检测方法,其中用酶进行所述消化。
5. 权利要求4的检测方法,其中所述酶是胰蛋白酶。
6. 权利要求1-5中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括CMY、CTX-M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA或GES蛋白或肽。
7. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.166到SEQ ID No.218、SEQ ID No.220到SEQ ID No.230、SEQ ID No.232到SEQ ID No.241、SEQ ID No.243到SEQ ID No.252、SEQ ID No.254到SEQ ID No.257、SEQ ID No.259到SEQ ID No.261、SEQ ID No.1923、SEQ ID No.1927和SEQ ID No.1928的肽的TEM肽。
8. 权利要求7的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.166、SEQ ID No.167、SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.170、SEQ ID No.171、SEQ ID No.172、SEQ ID No.173、SEQ ID No.174、SEQ ID No.180、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.187、SEQ ID No.188、SEQ ID No.189、SEQ ID No.190、SEQ ID No.191、SEQ ID No.192、SEQ ID No.193、SEQ ID No.194、SEQ ID No.195、SEQ ID No.196、SEQ ID No.197、SEQ ID No.198、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.201、SEQ ID No.202、SEQ ID No.203、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.219、SEQ ID No.220、SEQ ID No.223、SEQ ID No.224、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.228、SEQ ID No.229、SEQ ID No.230、SEQ ID No.241、SEQ ID No.242、SEQ ID No.243、SEQ ID No.250、SEQ ID No.251、SEQ ID No.252、SEQ ID No.253、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.259、SEQ ID No.260、SEQ ID No.261、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928的肽的TEM标记。
9. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性是ESBL,所述抗性标记肽包括选自序列SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.179、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.205、SEQ ID No.206、SEQ ID No.208、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.222、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.230、SEQ ID No.234、SEQ ID No.236、SEQ ID No.237、SEQ ID No.238、SEQ ID No.239、SEQ ID No.240、SEQ ID No.249、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.256、SEQ ID No.259、SEQ ID No.261、SEQ ID No.446、SEQ ID No.447、SEQ ID No.448、SEQ ID No.449、SEQ ID No.450、SEQ ID No.451、SEQ ID No.452、SEQ ID No.453、SEQ ID No.454、SEQ ID No.455、SEQ ID No.456、SEQ ID No.457、SEQ ID No.458、SEQ ID No.459、SEQ ID No.460、SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.465、SEQ ID No.466、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.469、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.472、SEQ ID No.473、SEQ ID No.474、SEQ ID No.475、SEQ ID No.476、SEQ ID No.477、SEQ ID No.478、SEQ ID No.480、SEQ ID No.481、SEQ ID No.482、SEQ ID No.483、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.486、SEQ ID No.487、SEQ ID No.488、SEQ ID No.489、SEQ ID No.490、SEQ ID No.491、SEQ ID No.492、SEQ ID No.493、SEQ ID No.494、SEQ ID No.495、SEQ ID No.615、SEQ ID No.634、SEQ ID No.646、SEQ ID No.651、SEQ ID No.659、SEQ ID No.663、SEQ ID No.665、SEQ ID No.678、SEQ ID No.683、SEQ ID No.686、SEQ ID No.690、SEQ ID No.702、SEQ ID No.705、SEQ ID No.1045、SEQ ID No.1046、SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1052、SEQ ID No.1053、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1056、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1058、SEQ ID No.1059、SEQ ID No.1060、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1062、SEQ ID No.1063、SEQ ID No.1064、SEQ ID No.1065、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1070、SEQ ID No.1071、SEQ ID No.1072、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1074、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076、SEQ ID No.1077、SEQ ID No.1085、SEQ ID No.1086、SEQ ID No.1087、SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1090、SEQ ID No.1091、SEQ ID No.1092、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1094、SEQ ID No.1095、SEQ ID No.1096、SEQ ID No.1097、SEQ ID No.1098、SEQ ID No.1099、SEQ ID No.1100、SEQ ID No.1101、SEQ ID No.1102、SEQ ID No.1103、SEQ ID No.1104、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928、SEQ ID No.2009、SEQ ID No.2010、SEQ ID No.2011、SEQ ID No.2012、SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092、SEQ ID No.2095、SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134、SEQ ID No.2135、SEQ ID No.2136、SEQ ID No.2137、SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141、SEQ ID No.2142、SEQ ID No.2143、SEQ ID No.2144、SEQ ID No.2145、SEQ ID No.2146、SEQ ID No.2147、SEQ ID No.2148、SEQ ID No.2149、SEQ ID No.2150、SEQ ID No.2151、SEQ ID No.2152、SEQ ID No.2153、SEQ ID No.2154、SEQ ID No.2155、SEQ ID No.2157、SEQ ID No.2158、SEQ ID No.2159、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽。
10. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.312到SEQ ID No.320、SEQ ID No.322到SEQ ID No.343、SEQ ID No.345到SEQ ID No.350、SEQ ID No.1929、SEQ ID No.1931到SEQ ID No.1934、SEQ ID No.1936、SEQ ID No.1938、SEQ ID No.1939、SEQ ID No.1940、SEQ ID No.1942、SEQ ID No.1944、SEQ ID No.1945、SEQ ID No.1946、SEQ ID No.1948、SEQ ID No.1949、SEQ ID No.1951、SEQ ID No.1953到SEQ ID No.1962、SEQ ID No.1969、SEQ ID No.1970、SEQ ID No.1971、SEQ ID No.1978、SEQ ID No.1980、SEQ ID No.1981、SEQ ID No.1982、SEQ ID No.1984到SEQ ID No.1999、SEQ ID No.2001、SEQ ID No.2002、SEQ ID No.2003、SEQ ID No.2004、SEQ ID No.2007的肽的CMY肽。
11. 权利要求10的检测方法,其中所述CMY肽选自序列为SEQ ID No.312、SEQ ID No.313、SEQ ID No.314、SEQ ID No.315、SEQ ID No.316、SEQ ID No.317、SEQ ID No.318、SEQ ID No.320、SEQ ID No.322、SEQ ID No.323、SEQ ID No.325、SEQ ID No.326、SEQ ID No.327、SEQ ID No.328、SEQ ID No.330、SEQ ID No.331、SEQ ID No.332、SEQ ID No.333、SEQ ID No.334、SEQ ID No.335、SEQ ID No.336、SEQ ID No.339、SEQ ID No.340、SEQ ID No.350、SEQ ID No.337、SEQ ID No.343的肽。
12. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.446到SEQ ID No.478、SEQ ID No.480到SEQ ID No.495和SEQ ID No.2009到SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092的肽的CTX-M肽。
13. 权利要求12的检测方法,其中所述CTX-M肽选自序列为SEQ ID No.446、SEQ ID No.451、SEQ ID No.454、SEQ ID No.458、SEQ ID No.460、SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.474、SEQ ID No.480、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.489、SEQ ID No.491的肽。
14. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.614到SEQ ID No.711和SEQ ID No.2093到SEQ ID No.2096的肽的SHV肽。
15. 权利要求14的检测方法,其中所述SHV肽选自序列为SEQ ID No.614、SEQ ID No.617、SEQ ID No.618、SEQ ID No.619、SEQ ID No.620、SEQ ID No.622、SEQ ID No.624、SEQ ID No.626、SEQ ID No.628、SEQ ID No.630、SEQ ID No.631、SEQ ID No.632、SEQ ID No.636、SEQ ID No.637、SEQ ID No.638、SEQ ID No.649、SEQ ID No.651、SEQ ID No.652、SEQ ID No.653、SEQ ID No.655、SEQ ID No.656、SEQ ID No.657、SEQ ID No.658、SEQ ID No.659、SEQ ID No.660、SEQ ID No.661、SEQ ID No.662、SEQ ID No.663、SEQ ID No.664、SEQ ID No.666、SEQ ID No.667、SEQ ID No.668、SEQ ID No.671、SEQ ID No.672、SEQ ID No.674、SEQ ID No.682、SEQ ID No.684、SEQ ID No.686、SEQ ID No.689、SEQ ID No.691、SEQ ID No.694、SEQ ID No.695、SEQ ID No.696、SEQ ID No.697、SEQ ID No.698、SEQ ID No.701、SEQ ID No.702、SEQ ID No.704、SEQ ID No.707、SEQ ID No.708的肽。
16. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.719到SEQ ID No.733、SEQ ID No.2098、SEQ ID No.2101、SEQ ID No.2102、SEQ ID No.2105、SEQ ID No.2107、SEQ ID No.2108、SEQ ID No.2109、SEQ ID No.2110、SEQ ID No.2112和SEQ ID No.2113的肽的FOX肽。
17. 权利要求16的检测方法,其中所述FOX肽选自序列为SEQ ID No.719、SEQ ID No.720、SEQ ID No.721、SEQ ID No.723、SEQ ID No.724、SEQ ID No.725、SEQ ID No.726、SEQ ID No.727、SEQ ID No.728、SEQ ID No.729、SEQ ID No.730、SEQ ID No.731、SEQ ID No.732的肽。
18. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括 选自序列为SEQ ID No.740到SEQ ID No.787的肽的ACC肽。
19. 权利要求18的检测方法,其中所述ACC肽选自序列为SEQ ID No.740、SEQ ID No.741、SEQ ID No.742、SEQ ID No.743、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.746、SEQ ID No.747、SEQ ID No.748、SEQ ID No.751、SEQ ID No.755、SEQ ID No.756、SEQ ID No.757、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.762、SEQ ID No.763、SEQ ID No.765、SEQ ID No.766、SEQ ID No.767、SEQ ID No.768、SEQ ID No.769、SEQ ID No.770、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.774、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.777、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.780、SEQ ID No.781、SEQ ID No.782、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.785、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的肽。
20. 权利要求18的检测方法,其中所述ACC肽选自序列为SEQ ID No.741、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.756、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.765、SEQ ID No.767、SEQ ID No.769、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.781、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的肽。
21. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.798、SEQ ID No.799、SEQ ID No.802、SEQ ID No.804到SEQ ID No.807、SEQ ID No.809到SEQ ID No.813、SEQ ID No.816到SEQ ID No.826、SEQ ID No.828到SEQ ID No.841的肽的ACT肽。
22. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.853到SEQ ID No.921的肽的CARB肽。
23. 权利要求22的检测方法,其中所述CARB肽选自序列为SEQ ID No.853、SEQ ID No.854、SEQ ID No.855、SEQ ID No.856、SEQ ID No.857、SEQ ID No.859、SEQ ID No.860、SEQ ID No.861、SEQ ID No.865、SEQ ID No.866、SEQ ID No.867、SEQ ID No.868、SEQ ID No.869、SEQ ID No.870、SEQ ID No.871、SEQ ID No.872、SEQ ID No.873、SEQ ID No.874、SEQ ID No.875、SEQ ID No.876、SEQ ID No.877、SEQ ID No.878、SEQ ID No.882、SEQ ID No.883、SEQ ID No.884、SEQ ID No.886、SEQ ID No.887、SEQ ID No.889、SEQ ID No.890、SEQ ID No.891、SEQ ID No.892、SEQ ID No.893、 SEQ ID No.894、SEQ ID No.896、SEQ ID No.897、SEQ ID No.898、SEQ ID No.899、SEQ ID No.900、SEQ ID No.901、SEQ ID No.903、SEQ ID No.904、SEQ ID No.905、SEQ ID No.906、SEQ ID No.907、SEQ ID No.908、SEQ ID No.909、SEQ ID No.911、SEQ ID No.912、SEQ ID No.913、SEQ ID No.915、SEQ ID No.916、SEQ ID No.917、SEQ ID No.918、SEQ ID No.919、SEQ ID No.920、SEQ ID No.921的肽。
24. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.928到SEQ ID No.935、SEQ ID No.937到SEQ ID No.942、SEQ ID No.944到SEQ ID No.948的肽的DHA肽。
25. 权利要求24的检测方法,其中所述DHA肽选自序列为SEQ ID No.929、SEQ ID No.931、SEQ ID No.932、SEQ ID No.934、SEQ ID No.937、SEQ ID No.938、SEQ ID No.939、SEQ ID No.941、SEQ ID No.944、SEQ ID No.946、SEQ ID No.947、SEQ ID No.948的肽。
26. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.954、SEQ ID No.956、SEQ ID No.957、SEQ ID No.959到SEQ ID No.961、SEQ ID No.963、SEQ ID No.964、SEQ ID No.966、SEQ ID No.967、SEQ ID No.969到SEQ ID No.981的肽的MIR肽。
27. 权利要求26的检测方法,其中所述MIR肽选自序列为SEQ ID No.979、SEQ ID No.980、SEQ ID No.981的肽。
28. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.990到SEQ ID No.993、SEQ ID No.995到SEQ ID No.998、SEQ ID No.1000到SEQ ID No.1012、SEQ ID No.1014到SEQ ID No.1016、SEQ ID No.1018到SEQ ID No.1020、SEQ ID No.1022到SEQ ID No.1029和SEQ ID No.1031到SEQ ID No.1037的肽的MOX肽。
29. 权利要求28的检测方法,其中所述MOX肽选自序列为SEQ ID No.992、SEQ ID No.1015、SEQ ID No.1006、SEQ ID No.1023、SEQ ID No.1024、SEQ ID No.1035、SEQ ID No.1036、SEQ ID No.1037的肽。
30. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1045到SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051到SEQ ID No.1065和SEQ ID No.1069到SEQ ID No.1077的肽的PER肽。
31. 权利要求30的检测方法,其中所述PER肽选自序列为SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076的肽。
32. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1085到SEQ ID No.1104的肽的VEB肽。
33. 权利要求32的检测方法,其中所述VEB肽选自序列为SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1103的肽。
34. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1267、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1273、SEQ ID No.1274、SEQ ID No.1275、SEQ ID No.1276、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1284、SEQ ID No.1286、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1289、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1291、SEQ ID No.1292、SEQ ID No.1293、SEQ ID No.1294、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1296、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1298、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1311、SEQ ID No.1312、SEQ ID No.1313、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1321、SEQ ID No.1322、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1324、SEQ ID No.1325、SEQ ID No.1329、SEQ ID No.1330、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1333、SEQ ID No.1334、SEQ ID No.1335、SEQ ID No.1336、SEQ ID No.1338、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1345、SEQ ID No.1346、SEQ ID No.1347、SEQ ID No.1348、SEQ ID No.1349、SEQ ID No.1351、SEQ ID No.1352、SEQ ID No.1353、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1362、SEQ ID No.1364、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1370、SEQ ID No.1371、SEQ ID No.1372、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1374、SEQ ID No.1376、SEQ ID No.1378、SEQ ID No.1380、SEQ ID No.1381、SEQ ID No.1382、SEQ ID No.1383、SEQ ID No.1384、SEQ ID No.1385、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1395、SEQ ID No.1396、SEQ ID No.1397、SEQ ID No.1398、SEQ ID No.1399、SEQ ID No.1400、SEQ ID No.1401、SEQ ID No.1403、SEQ ID No.1406、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1409、SEQ ID No.1410、SEQ ID No.1411、SEQ ID No.1412、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1417、SEQ ID No.1418、SEQ ID No.1422、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1424、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1428、SEQ ID No.1430、SEQ ID No.1431、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1434、SEQ ID No.1435、SEQ ID No.1436、SEQ ID No.1437、SEQ ID No.1438、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1443、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1445、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1449、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1452、SEQ ID No.1454、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1458、SEQ ID No.1459、SEQ ID No.1460、SEQ ID No.1461、SEQ ID No.1464、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1475、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1483、SEQ ID No.1484、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1486、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1493、SEQ ID No.1494、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1496、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1501、SEQ ID No.1502、SEQ ID No.1503、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1505、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1507、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1511、SEQ ID No.1512、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1517、SEQ ID No.1518、SEQ ID No.1520、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1524、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1527、SEQ ID No.1528、SEQ ID No.1529、SEQ ID No.1531、SEQ ID No.1532、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1535、SEQ ID No.1536、SEQ ID No.1537、SEQ ID No.1538、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1541、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1544、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1546、SEQ ID No.1547、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1557、SEQ ID No.1558、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1561、SEQ ID No.1562、SEQ ID No.1563、SEQ ID No.1564、SEQ ID No.1565、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1568、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1573、SEQ ID No.1576、SEQ ID No.1579、SEQ ID No.1580、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1583、SEQ ID No.1584、SEQ ID No.1585、SEQ ID No.1586、SEQ ID No.1587、SEQ ID No.1588、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1591、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1593、SEQ ID No.1594、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1599、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1603、SEQ ID No.1604、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1606、SEQ ID No.1607、SEQ ID No.1608、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1619、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1623、SEQ ID No.1624、SEQ ID No.1625、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1629、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1636、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1641、SEQ ID No.1642、SEQ ID No.1643、SEQ ID No.1644、SEQ ID No.1645、SEQ ID No.1646、SEQ ID No.1647、SEQ ID No.1648、SEQ ID No.1649、SEQ ID No.1650、SEQ ID No.1651、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1654、SEQ ID No.1655、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1658、SEQ ID No.1659、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1663、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1667、SEQ ID No.1668、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1679、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1686、SEQ ID No.1688、SEQ ID No.1690、SEQ ID No.1693、SEQ ID No.1694、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1698、SEQ ID No.1699、SEQ ID No.1700、SEQ ID No.1701、SEQ ID No.1702、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1705、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1711、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1716、SEQ ID No.1719、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1726、SEQ ID No.1728、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1731、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1734、SEQ ID No.1735、SEQ ID No.1736、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1739、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1741、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1744、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1750、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1756、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1766、SEQ ID No.1767、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1770、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1772、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1778、SEQ ID No.1780、SEQ ID No.1782、SEQ ID No.1783、SEQ ID No.1784、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1786、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1789、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1799、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1802、SEQ ID No.1803、SEQ ID No.1804、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1807、SEQ ID No.1808、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1811、SEQ ID No.1812、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1817、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1820、SEQ ID No.1821、SEQ ID No.1822、SEQ ID No.1825、SEQ ID No.1826、SEQ ID No.1827、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1829、SEQ ID No.1830、SEQ ID No.1831、SEQ ID No.1832、SEQ ID No.1833、SEQ ID No.1834、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽的OXA肽。
35. 权利要求34的检测方法,其中所述OXA肽选自序列为SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽。
36. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134到SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141到SEQ ID No.2155和SEQ ID No.2157到SEQ ID No.2159的肽的GES肽。 ”
复审请求人认为:(1)对比文件1公开了区分cfiA阳性和阴性的脆弱拟杆菌分离株的分析。此分析以MALDI-TOF质谱进行。对比文件l的分析是一种指纹分析,即全谱(full spectrum)分析。对比文件1没有公开在将确定为抗性标记的特定蛋白质靶向片段化之后进行的多反应监测(MRM)模式的分析。此外,对比文件1没有公开使用TEM标记进行分析。(2)对比文件2公开了使用MRM检测和定量血浆中的低丰度蛋白质。对比文件2所公开的方法使用了稳定的同位素稀释(SID)该特定的方法,其需要使用同位素标记的肽作为标准品。对比文件2还描述了蛋白质消化步骤之前的去血浆(plasma depletion)步骤,该步骤可以去除在血浆中丰度最高的蛋白质。对比文件2还显示对于相同的肽而言,检测和定量的方式是不同的,取决于如何去除血浆;以及对于同一种蛋白质,其检测和定量是肽依赖性的(参见其第2217页表II)。也就是说,对比文件2所公开的方法是否适用取决于所靶向的肽。换言之,对用作抗性标记的肽的选择是非常重要的,并且是非显而易见的。必须要进行若干实验对候选的肽进行确认。对比文件2根本没有教导或提示使用TEM标记来检测头孢菌素抗性。(3)审查员将本申请权利要求中的技术方案分为16组,认为这16组技术方案的共同技术特征是:均涉及一种通过质谱检测样品中针对至少一种微生物的检测方法,即权利要求1的方法。审查员认为,上述共同技术特征不是特定技术特征,因此,上述16组技术方案之间没有单一性。权利要求1的全部技术特征都是修改后的权利要求的技术方案之间的共同技术特征。根据上文关于创造性的陈述,权利要求1的方法具备创造性。因此,修改后的权利要求的技术方案之间的共同技术特征包括对现有技术做出贡献的特定技术特征,权利要求1-36具备单一性。
经形式审查合格,国家知识产权局于2017年11月23日依法受理了该复审请求,并将其转送至原审查部门进行前置审查。
原审查部门在前置审查意见书中认为:对比文件1已经公开了一种利用质谱检测样品中脆弱拟杆菌针对碳青霉烯抗性的,以cfiA基因编码蛋白为抗性标记方法,并公开了相关步骤。可见,权利要求1与对比文件1的区别为:权利要求1限定了(1)抗菌剂是头孢菌素;(2)使用多反应监测模式的MS/MS;(3)抗性标记包括TEM。基于此,本发明实际要解决的技术问题是:获得另一种使用质谱检测头孢菌素抗性机制的方法。对于上述区别,头孢菌素和碳青霉烯均为β-内酰胺酶(cfiA基因编码其中一种)类抗生素,cfiA编码的金属类β-内酰胺酶是对广谱头孢菌素耐药的原因之一。本领域技术人员有动机针对头孢菌素进行耐药性检测,获得相关检测方法。在此基础上,本领域技术人员根据实验需求/实际情况,结合常规选择容易选取合适的抗性标记进行相关研究。对比文件2公开了一种多反应监测模式的串联质谱类型的质谱与SID-MS方法联合检测微生物样品中的特定低丰度蛋白的方法,通过实验证实了这种联合方法能够有效的检测目标蛋白,并进一步公开了相关蛋白样品被胰蛋白酶消化成肽。可见,对比文件2已经给出了使用多反应监测模式的串联质谱检测目标蛋白的技术启示。本领域技术人员为了更有效的检测目标蛋白,有动机利用对比文件2的多反应监测模式的串联质谱类型的质谱改进对比文件1的方法,并结合常规选择容易选用MS/MS类型。因而,坚持原驳回决定。
随后,国家知识产权局成立合议组对本案进行审理。
合议组于2019年02月12日向复审请求人发出复审通知书,指出:(一)关于创造性。权利要求1与对比文件1的区别在于:(1)其采用的质谱类型为多反应监测模式的MS/MS;(2)其所针对的抗性标记涉及TEM型β-内酰胺酶以及其相对应的抗菌剂抗性为头孢菌素。权利要求1相对于对比文件1实际解决的技术问题在于:其提供了利用质谱进行β-内酰胺酶抗性标记的类似检测方法。对于区别特征(1),对比文件2公开了利用靶向质谱和稳定的同位素稀释(SID)技术来多重定量检测血浆中的低丰度蛋白;其中具体公开了多反应监测模式的串联质谱类型的质谱(MRM LC-MS/MS)与SID联合可用于直接定量血浆中的蛋白。由此可见,对比文件2已经公开了利用多反应监测模式的MS/MS类型的质谱能够有效检测目标蛋白。因此,针对目标蛋白进行检测,本领域技术人员将会有动机在多种质谱检测方法中选择相对合适的一种具体质谱检测方法来进行。对于区别特征(2),《β-内酰胺酶与细菌耐药》(李金钟等.河北科学技术出版社.2007年)公开了β-内酰胺酶的TEM-1、TEM-2基因型可以水解三代头孢菌素或氨曲南,TEM-7、TEM-12基因型可以水解头孢他啶,TEM-3基因型(即CTX-1基因型)对头孢噻肟耐药,TEM-5、TEM-8、TEM-11、TEM-16、TEM-24、TEM-46、TEM-61、TEM-91和TEM-144基因型可以水解头孢他啶,TEM-50、TEM-68、TEM-89、TEM-109、TEM-121和TEM-125基因型对三代头孢菌素耐药,TEM-3、TEM-4基因型对头孢他啶、头孢曲松、头孢噻肟和氨曲南耐药,TEM-10基因型可以水解头孢他啶、氨曲南、哌拉西林和羧苄西林,以及TEM-134、TEM-138基因型可以水解头孢噻肟和头孢他啶等。由此可见,TEM型β-内酰胺酶与其相对应的头孢菌素抗性之间存在着某种关联性,这属于本领域的公知常识。因此,无论是对比文件1中公开的金属型β-内酰胺酶及其相关的碳青霉烯抗性,还是权利要求1中限定的TEM型β-内酰胺酶及其相关的头孢菌素抗性,它们均是本领域各种不同基因型β-内酰胺酶与其相对应抗性之间具有关联性的相关具体情形。总之,在对比文件1公开了利用MALDI-TOF质谱进行金属型β-内酰胺酶检测、进而进行碳青霉烯抗性预测该公开内容的基础上,本领域技术人员结合对比文件2和公知常识,将会有动机选择相对合适的MS/MS质谱类型作为替换手段,并且有动机将所述方法转用于本领域公知的TEM型β-内酰胺酶检测及其相应的头孢菌素抗性预测,从而获得权利要求1所述的技术方案,因此权利要求1不具备创造性。从属权利要求2、6-9的附加技术特征已经被上述公知常识(《β-内酰胺酶与细菌耐药》,李金钟等,河北科学技术出版社,2007年)所实质公开,从属权利要求3-5的附加技术特征则已经被对比文件2所实质公开,因此从属权利要求2-9也均不具备创造性。(二)关于单一性。权利要求6中所述TEM抗性标记与CTX-M、SHV、PER、VEB或GES抗性标记组合的相关技术方案,在对比文件1、对比文件2和公知常识的教导下不具备创造性。在此基础上,权利要求6所述不同抗性标记组合的各技术方案之间,不包含相同或相应的对现有技术作出贡献的特定技术特征,因此该各技术方案之间不具备单一性,不符合专利法第31条第1款的规定。同样地,权利要求7-36所涉及不同抗性标记组合和/或其不同质谱特征片段肽序列的各技术方案之间,它们也不包含相同或相应的对现有技术作出贡献的特定技术特征,因此这些技术方案之间也均不具备单一性。(三)针对意见陈述书,合议组认为:(1)虽然对比文件1是一种全谱(full spectrum)分析,其没有公开在将确定为抗性标记的特定蛋白质靶向片段化之后进行多反应监测(MRM)模式的分析,但是从对比文件1公开的整体内容来看,其利用全谱分析所要验证的是,通过质谱检测cfiA基因编码的B类金属型β-内酰胺酶、进而对碳青霉烯抗性进行预测该技术思路是否可行,而上述技术思路便是本申请的发明构思,即:对各种不同基因型的β-内酰胺酶进行检测、进而预测其相对应的抗性。因此,在对比文件1中已经验证上述技术思路可行的情形下,结合本领域不同基因型β-内酰胺酶与其相对应的抗菌剂抗性之间存在着某种关联性该公知常识(参见例如TEM型β-内酰胺酶. 李金钟等.《β-内酰胺酶与细菌耐药》.河北科学技术出版社.2007年;金属型β-内酰胺酶. 任南主编. 《实用医院感染监测方法与技术》.湖南科技出版社.2007年),本领域技术人员将会有动机对各种不同基因型的β-内酰胺酶进行质谱分析、进而获得相应的抗性预测,这属于相同发明构思的简单转用。(2)本领域技术人员知晓,MS/MS类型的质谱(即串联质谱/多级质谱联用)相对于单级质谱,通常既可以获得分子离子峰,又可以获得碎片离子峰,因此MS/MS类型的质谱相对于单级质谱,通常能够提供更多的碎片信息,通常能够检测混合物中的痕量成分。如上所述,对比文件2已经公开了利用多反应监测模式的MS/MS类型的质谱能够有效检测目标蛋白。因此,针对目标蛋白进行检测,本领域技术人员将会有动机选择相对合适的一种具体质谱检测方法来进行。需要指出的是,对比文件2中所公开的使用同位素标记的肽作为标准品、蛋白质消化步骤之前的去血浆步骤等等,它们均属于质谱检测的预处理相关步骤,本领域技术人员知晓根据目标蛋白的定性或定量情形,来选择或调整合适的预处理相关步骤(例如不用标准品,选择面积进行相对定量等等)。此外,使用TEM标记来检测头孢菌素抗性,如上所述,这属于本领域的公知常识。(3)在权利要求1-5不具备创造性、权利要求6部分不具备创造性的情形下,如上所述,权利要求6所述不同抗性标记组合的各技术方案之间,以及权利要求7-36所述不同抗性标记组合和/或其不同质谱特征片段肽序列的各技术方案之间,它们之间不包含相同或相应的对现有技术作出贡献的特定技术特征,因此它们之间均不具备单一性。
复审请求人于2019年05月27日提交了意见陈述书,同时修改了权利要求书,将权利要求7中的具体TEM肽序列并入权利要求1,并对权利要求书的序号和引用关系进行了适应性修改。复审请求人新修改的权利要求书如下:
“1. 一种通过多反应监测模式的MS/MS类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于: a)抗菌剂是头孢菌素;以及 b)所述抗性标记包括选自序列为SEQ ID No.166到SEQ ID No.218、SEQ ID No.220到SEQ ID No.230、SEQ ID No.232到SEQ ID No.241、SEQ ID No.243到SEQ ID No.252、SEQ ID No.254到SEQ ID No.257、SEQ ID No.259到SEQ ID No.261、SEQ ID No.1923、SEQ ID No.1927和SEQ ID No.1928的肽的TEM肽。
2. 权利要求1的检测方法,其中所述抗性标记是来源于所述至少一种微生物的蛋白质。
3. 权利要求2的检测方法,其中来源于所述微生物的蛋白质被消化成肽。
4. 权利要求3的检测方法,其中用酶进行所述消化。
5. 权利要求4的检测方法,其中所述酶是胰蛋白酶。
6. 权利要求1-5中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括CMY、CTX-M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA或GES蛋白或肽。
7. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记是选自序列为SEQ ID No.166、SEQ ID No.167、SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.170、SEQ ID No.171、SEQ ID No.172、SEQ ID No.173、SEQ ID No.174、SEQ ID No.180、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.187、SEQ ID No.188、SEQ ID No.189、SEQ ID No.190、SEQ ID No.191、SEQ ID No.192、SEQ ID No.193、SEQ ID No.194、SEQ ID No.195、SEQ ID No.196、SEQ ID No.197、SEQ ID No.198、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.201、SEQ ID No.202、SEQ ID No.203、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.219、SEQ ID No.220、SEQ ID No.223、SEQ ID No.224、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.228、SEQ ID No.229、SEQ ID No.230、SEQ ID No.241、SEQ ID No.242、SEQ ID No.243、SEQ ID No.250、 SEQ ID No.251、SEQ ID No.252、SEQ ID No.253、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.259、SEQ ID No.260、SEQ ID No.261、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928的肽的TEM标记。
8. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性是ESBL,所述抗性标记肽包括选自序列SEQ ID No.168、SEQ ID No.169、SEQ ID No.179、SEQ ID No.181、SEQ ID No.186、SEQ ID No.199、SEQ ID No.200、SEQ ID No.205、SEQ ID No.206、SEQ ID No.208、SEQ ID No.212、SEQ ID No.213、SEQ ID No.214、SEQ ID No.215、SEQ ID No.216、SEQ ID No.217、SEQ ID No.222、SEQ ID No.225、SEQ ID No.226、SEQ ID No.227、SEQ ID No.230、SEQ ID No.234、SEQ ID No.236、SEQ ID No.237、SEQ ID No.238、SEQ ID No.239、SEQ ID No.240、SEQ ID No.249、SEQ ID No.254、SEQ ID No.255、SEQ ID No.256、SEQ ID No.259、SEQ ID No.261、SEQ ID No.446、SEQ ID No.447、SEQ ID No.448、SEQ ID No.449、SEQ ID No.450、SEQ ID No.451、SEQ ID No.452、SEQ ID No.453、SEQ ID No.454、SEQ ID No.455、SEQ ID No.456、SEQ ID No.457、SEQ ID No.458、SEQ ID No.459、SEQ ID No.460、SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.465、SEQ ID No.466、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.469、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.472、SEQ ID No.473、SEQ ID No.474、SEQ ID No.475、SEQ ID No.476、SEQ ID No.477、SEQ ID No.478、SEQ ID No.480、SEQ ID No.481、SEQ ID No.482、SEQ ID No.483、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.486、SEQ ID No.487、SEQ ID No.488、SEQ ID No.489、SEQ ID No.490、SEQ ID No.491、SEQ ID No.492、SEQ ID No.493、SEQ ID No.494、SEQ ID No.495、SEQ ID No.615、SEQ ID No.634、SEQ ID No.646、SEQ ID No.651、SEQ ID No.659、SEQ ID No.663、SEQ ID No.665、SEQ ID No.678、SEQ ID No.683、SEQ ID No.686、SEQ ID No.690、SEQ ID No.702、SEQ ID No.705、SEQ ID No.1045、SEQ ID No.1046、SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1052、SEQ ID No.1053、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1056、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1058、SEQ ID No.1059、SEQ ID No.1060、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1062、SEQ ID No.1063、SEQ ID No.1064、SEQ ID No.1065、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1070、SEQ ID No.1071、SEQ ID No.1072、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1074、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076、SEQ ID No.1077、SEQ ID No.1085、SEQ ID No.1086、SEQ ID No.1087、SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1090、SEQ ID No.1091、SEQ ID No.1092、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1094、SEQ ID No.1095、SEQ ID No.1096、SEQ ID No.1097、SEQ ID No.1098、SEQ ID No.1099、SEQ ID No.1100、SEQ ID No.1101、SEQ ID No.1102、SEQ ID No.1103、SEQ ID No.1104、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1927、SEQ ID No.1928、SEQ ID No.2009、SEQ ID No.2010、SEQ ID No.2011、SEQ ID No.2012、SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092、SEQ ID No.2095、SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134、SEQ ID No.2135、SEQ ID No.2136、SEQ ID No.2137、SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141、SEQ ID No.2142、SEQ ID No.2143、SEQ ID No.2144、SEQ ID No.2145、SEQ ID No.2146、SEQ ID No.2147、SEQ ID No.2148、SEQ ID No.2149、SEQ ID No.2150、SEQ ID No.2151、SEQ ID No.2152、SEQ ID No.2153、SEQ ID No.2154、SEQ ID No.2155、SEQ ID No.2157、SEQ ID No.2158、SEQ ID No.2159、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽。
9. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.312到SEQ ID No.320、SEQ ID No.322到SEQ ID No.343、SEQ ID No.345到SEQ ID No.350、SEQ ID No.1929、SEQ ID No.1931到SEQ ID No.1934、SEQ ID No.1936、SEQ ID No.1938、SEQ ID No.1939、SEQ ID No.1940、SEQ ID No.1942、SEQ ID No.1944、SEQ ID No.1945、SEQ ID No.1946、SEQ ID No.1948、SEQ ID No.1949、SEQ ID No.1951、SEQ ID No.1953到SEQ ID No.1962、SEQ ID No.1969、SEQ ID No.1970、SEQ ID No.1971、SEQ ID No.1978、SEQ ID No.1980、SEQ ID No.1981、SEQ ID No.1982、SEQ ID No.1984到SEQ ID No.1999、SEQ ID No.2001、SEQ ID No.2002、SEQ ID No.2003、SEQ ID No.2004、SEQ ID No.2007的肽的CMY肽。
10. 权利要求9的检测方法,其中所述CMY肽选自序列为SEQ ID No.312、SEQ ID No.313、SEQ ID No.314、SEQ ID No.315、SEQ ID No.316、SEQ ID No.317、SEQ ID No.318、SEQ ID No.320、SEQ ID No.322、SEQ ID No.323、SEQ ID No.325、SEQ ID No.326、SEQ ID No.327、SEQ ID No.328、SEQ ID No.330、SEQ ID No.331、SEQ ID No.332、SEQ ID No.333、SEQ ID No.334、SEQ ID No.335、SEQ ID No.336、SEQ ID No.339、SEQ ID No.340、SEQ ID No.350、SEQ ID No.337、SEQ ID No.343的肽。
11. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.446到SEQ ID No.478、SEQ ID No.480到SEQ ID No.495和SEQ ID No.2009到SEQ ID No.2013、SEQ ID No.2015、SEQ ID No.2017、SEQ ID No.2019、SEQ ID No.2021、SEQ ID No.2022、SEQ ID No.2023、SEQ ID No.2024、SEQ ID No.2025、SEQ ID No.2026、SEQ ID No.2027、SEQ ID No.2029、SEQ ID No.2030、SEQ ID No.2032、SEQ ID No.2034、SEQ ID No.2035、SEQ ID No.2036、SEQ ID No.2037、SEQ ID No.2038、SEQ ID No.2039、SEQ ID No.2042、SEQ ID No.2043、SEQ ID No.2044、SEQ ID No.2045、SEQ ID No.2046、SEQ ID No.2047、SEQ ID No.2048、SEQ ID No.2049、SEQ ID No.2050、SEQ ID No.2051、SEQ ID No.2054、SEQ ID No.2055、SEQ ID No.2057、SEQ ID No.2058、SEQ ID No.2059、SEQ ID No.2060、SEQ ID No.2061、SEQ ID No.2062、SEQ ID No.2063、SEQ ID No.2065、SEQ ID No.2066、SEQ ID No.2067、SEQ ID No.2069、SEQ ID No.2070、SEQ ID No.2071、SEQ ID No.2072、SEQ ID No.2073、SEQ ID No.2074、SEQ ID No.2076、SEQ ID No.2077、SEQ ID No.2078、SEQ ID No.2081、SEQ ID No.2082、SEQ ID No.2083、SEQ ID No.2084、SEQ ID No.2085、SEQ ID No.2086、SEQ ID No.2087、SEQ ID No.2088、SEQ ID No.2090、SEQ ID No.2091、SEQ ID No.2092的肽的CTX-M肽。
12. 权利要求11的检测方法,其中所述CTX-M肽选自序列为SEQ ID No.446、SEQ ID No.451、SEQ ID No.454、SEQ ID No.458、SEQ ID No.460、 SEQ ID No.461、SEQ ID No.462、SEQ ID No.463、SEQ ID No.464、SEQ ID No.467、SEQ ID No.468、SEQ ID No.470、SEQ ID No.471、SEQ ID No.474、SEQ ID No.480、SEQ ID No.484、SEQ ID No.485、SEQ ID No.489、SEQ ID No.491的肽。
13. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.614到SEQ ID No.711和SEQ ID No.2093到SEQ ID No.2096的肽的SHV肽。
14. 权利要求13的检测方法,其中所述SHV肽选自序列为SEQ ID No.614、SEQ ID No.617、SEQ ID No.618、SEQ ID No.619、SEQ ID No.620、SEQ ID No.622、SEQ ID No.624、SEQ ID No.626、SEQ ID No.628、SEQ ID No.630、SEQ ID No.631、SEQ ID No.632、SEQ ID No.636、SEQ ID No.637、SEQ ID No.638、SEQ ID No.649、SEQ ID No.651、SEQ ID No.652、SEQ ID No.653、SEQ ID No.655、SEQ ID No.656、SEQ ID No.657、SEQ ID No.658、SEQ ID No.659、SEQ ID No.660、SEQ ID No.661、SEQ ID No.662、SEQ ID No.663、SEQ ID No.664、SEQ ID No.666、SEQ ID No.667、SEQ ID No.668、SEQ ID No.671、SEQ ID No.672、SEQ ID No.674、SEQ ID No.682、SEQ ID No.684、SEQ ID No.686、SEQ ID No.689、SEQ ID No.691、SEQ ID No.694、SEQ ID No.695、SEQ ID No.696、SEQ ID No.697、SEQ ID No.698、SEQ ID No.701、SEQ ID No.702、SEQ ID No.704、SEQ ID No.707、SEQ ID No.708的肽。
15. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.719到SEQ ID No.733、SEQ ID No.2098、SEQ ID No.2101、SEQ ID No.2102、SEQ ID No.2105、SEQ ID No.2107、SEQ ID No.2108、SEQ ID No.2109、SEQ ID No.2110、SEQ ID No.2112和SEQ ID No.2113的肽的FOX肽。
16. 权利要求15的检测方法,其中所述FOX肽选自序列为SEQ ID No.719、SEQ ID No.720、SEQ ID No.721、SEQ ID No.723、SEQ ID No.724、SEQ ID No.725、SEQ ID No.726、SEQ ID No.727、SEQ ID No.728、SEQ ID No.729、SEQ ID No.730、SEQ ID No.731、SEQ ID No.732的肽。
17. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.740到SEQ ID No.787的肽的ACC肽。
18. 权利要求17的检测方法,其中所述ACC肽选自序列为SEQ ID No.740、SEQ ID No.741、SEQ ID No.742、SEQ ID No.743、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.746、SEQ ID No.747、SEQ ID No.748、SEQ ID No.751、SEQ ID No.755、SEQ ID No.756、SEQ ID No.757、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.762、SEQ ID No.763、SEQ ID No.765、SEQ ID No.766、SEQ ID No.767、SEQ ID No.768、SEQ ID No.769、SEQ ID No.770、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.774、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.777、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.780、SEQ ID No.781、SEQ ID No.782、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.785、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的肽。
19. 权利要求17的检测方法,其中所述ACC肽选自序列为SEQ ID No.741、SEQ ID No.744、SEQ ID No.745、SEQ ID No.756、SEQ ID No.758、SEQ ID No.761、SEQ ID No.765、SEQ ID No.767、SEQ ID No.769、SEQ ID No.771、SEQ ID No.773、SEQ ID No.775、SEQ ID No.776、SEQ ID No.778、SEQ ID No.779、SEQ ID No.781、SEQ ID No.783、SEQ ID No.784、SEQ ID No.786、SEQ ID No.787的肽。
20. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.798、SEQ ID No.799、SEQ ID No.802、SEQ ID No.804到SEQ ID No.807、SEQ ID No.809到SEQ ID No.813、SEQ ID No.816到SEQ ID No.826、SEQ ID No.828到SEQ ID No.841的肽的ACT肽。
21. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.853到SEQ ID No.921的肽的CARB肽。
22. 权利要求21的检测方法,其中所述CARB肽选自序列为SEQ ID No.853、SEQ ID No.854、SEQ ID No.855、SEQ ID No.856、SEQ ID No.857、SEQ ID No.859、SEQ ID No.860、SEQ ID No.861、SEQ ID No.865、SEQ ID No.866、SEQ ID No.867、SEQ ID No.868、SEQ ID No.869、SEQ ID No.870、SEQ ID No.871、SEQ ID No.872、SEQ ID No.873、SEQ ID No.874、SEQ ID No.875、SEQ ID No.876、SEQ ID No.877、SEQ ID No.878、SEQ ID No.882、SEQ ID No.883、SEQ ID No.884、SEQ ID No.886、SEQ ID No.887、SEQ ID No.889、SEQ ID No.890、SEQ ID No.891、SEQ ID No.892、SEQ ID No.893、SEQ ID No.894、SEQ ID No.896、SEQ ID No.897、SEQ ID No.898、SEQ ID No.899、SEQ ID No.900、SEQ ID No.901、SEQ ID No.903、SEQ ID No.904、SEQ ID No.905、SEQ ID No.906、SEQ ID No.907、SEQ ID No.908、SEQ ID No.909、SEQ ID No.911、SEQ ID No.912、SEQ ID No.913、SEQ ID No.915、SEQ ID No.916、SEQ ID No.917、SEQ ID No.918、SEQ ID No.919、SEQ ID No.920、SEQ ID No.921的肽。
23. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.928到SEQ ID No.935、SEQ ID No.937到SEQ ID No.942、SEQ ID No.944到SEQ ID No.948的肽的DHA肽。
24. 权利要求23的检测方法,其中所述DHA肽选自序列为SEQ ID No.929、SEQ ID No.931、SEQ ID No.932、SEQ ID No.934、SEQ ID No.937、SEQ ID No.938、SEQ ID No.939、SEQ ID No.941、SEQ ID No.944、SEQ ID No.946、SEQ ID No.947、SEQ ID No.948的肽。
25. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.954、SEQ ID No.956、SEQ ID No.957、SEQ ID No.959到SEQ ID No.961、SEQ ID No.963、SEQ ID No.964、SEQ ID No.966、SEQ ID No.967、SEQ ID No.969到SEQ ID No.981的肽的MIR肽。
26. 权利要求25的检测方法,其中所述MIR肽选自序列为SEQ ID No.979、SEQ ID No.980、SEQ ID No.981的肽。
27. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.990到SEQ ID No.993、SEQ ID No.995到SEQ ID No.998、SEQ ID No.1000到SEQ ID No.1012、SEQ ID No.1014到SEQ ID No.1016、SEQ ID No.1018到SEQ ID No.1020、SEQ ID No.1022到SEQ ID No.1029和SEQ ID No.1031到SEQ ID No.1037的肽的MOX肽。
28. 权利要求27的检测方法,其中所述MOX肽选自序列为SEQ ID No.992、SEQ ID No.1015、SEQ ID No.1006、SEQ ID No.1023、SEQ ID No.1024、SEQ ID No.1035、SEQ ID No.1036、SEQ ID No.1037的肽。
29. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1045到SEQ ID No.1047、SEQ ID No.1051到SEQ ID No.1065和SEQ ID No.1069到SEQ ID No.1077的肽的PER肽。
30. 权利要求29的检测方法,其中所述PER肽选自序列为SEQ ID No.1051、SEQ ID No.1054、SEQ ID No.1055、SEQ ID No.1057、SEQ ID No.1061、SEQ ID No.1069、SEQ ID No.1073、SEQ ID No.1075、SEQ ID No.1076的肽。
31. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1085到SEQ ID No.1104的肽的VEB肽。
32. 权利要求31的检测方法,其中所述VEB肽选自序列为SEQ ID No.1088、SEQ ID No.1089、SEQ ID No.1093、SEQ ID No.1103的肽。
33. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.1267、SEQ ID No.1268、SEQ ID No.1270、SEQ ID No.1271、SEQ ID No.1272、SEQ ID No.1273、SEQ ID No.1274、SEQ ID No.1275、SEQ ID No.1276、SEQ ID No.1277、SEQ ID No.1278、SEQ ID No.1279、SEQ ID No.1280、SEQ ID No.1281、SEQ ID No.1283、SEQ ID No.1284、SEQ ID No.1286、SEQ ID No.1288、SEQ ID No.1289、SEQ ID No.1290、SEQ ID No.1291、SEQ ID No.1292、SEQ ID No.1293、SEQ ID No.1294、SEQ ID No.1295、SEQ ID No.1296、SEQ ID No.1297、SEQ ID No.1298、SEQ ID No.1299、SEQ ID No.1300、SEQ ID No.1301、SEQ ID No.1302、SEQ ID No.1303、SEQ ID No.1304、SEQ ID No.1305、SEQ ID No.1306、SEQ ID No.1307、SEQ ID No.1308、SEQ ID No.1309、SEQ ID No.1310、SEQ ID No.1311、SEQ ID No.1312、SEQ ID No.1313、SEQ ID No.1314、SEQ ID No.1315、SEQ ID No.1316、SEQ ID No.1317、SEQ ID No.1318、SEQ ID No.1319、SEQ ID No.1320、SEQ ID No.1321、SEQ ID No.1322、SEQ ID No.1323、SEQ ID No.1324、SEQ ID No.1325、SEQ ID No.1329、SEQ ID No.1330、SEQ ID No.1332、SEQ ID No.1333、SEQ ID No.1334、SEQ ID No.1335、SEQ ID No.1336、SEQ ID No.1338、SEQ ID No.1339、SEQ ID No.1341、SEQ ID No.1342、SEQ ID No.1344、SEQ ID No.1345、SEQ ID No.1346、SEQ ID No.1347、SEQ ID No.1348、SEQ ID No.1349、SEQ ID No.1351、SEQ ID No.1352、SEQ ID No.1353、SEQ ID No.1354、SEQ ID No.1355、SEQ ID No.1356、SEQ ID No.1357、SEQ ID No.1358、SEQ ID No.1359、SEQ ID No.1360、SEQ ID No.1362、SEQ ID No.1364、SEQ ID No.1365、SEQ ID No.1367、SEQ ID No.1369、SEQ ID No.1370、SEQ ID No.1371、SEQ ID No.1372、SEQ ID No.1373、SEQ ID No.1374、SEQ ID No.1376、SEQ ID No.1378、SEQ ID No.1380、SEQ ID No.1381、SEQ ID No.1382、SEQ ID No.1383、SEQ ID No.1384、SEQ ID No.1385、SEQ ID No.1390、SEQ ID No.1391、SEQ ID No.1393、SEQ ID No.1394、SEQ ID No.1395、SEQ ID No.1396、SEQ ID No.1397、SEQ ID No.1398、SEQ ID No.1399、SEQ ID No.1400、SEQ ID No.1401、SEQ ID No.1403、SEQ ID No.1406、SEQ ID No.1407、SEQ ID No.1409、SEQ ID No.1410、SEQ ID No.1411、SEQ ID No.1412、SEQ ID No.1413、SEQ ID No.1414、SEQ ID No.1417、SEQ ID No.1418、SEQ ID No.1422、SEQ ID No.1423、SEQ ID No.1424、SEQ ID No.1425、SEQ ID No.1427、SEQ ID No.1428、SEQ ID No.1430、SEQ ID No.1431、SEQ ID No.1432、SEQ ID No.1433、SEQ ID No.1434、SEQ ID No.1435、SEQ ID No.1436、SEQ ID No.1437、SEQ ID No.1438、SEQ ID No.1439、SEQ ID No.1443、SEQ ID No.1444、SEQ ID No.1445、SEQ ID No.1446、SEQ ID No.1447、SEQ ID No.1448、SEQ ID No.1449、SEQ ID No.1450、SEQ ID No.1451、SEQ ID No.1452、SEQ ID No.1454、SEQ ID No.1456、SEQ ID No.1457、SEQ ID No.1458、SEQ ID No.1459、SEQ ID No.1460、SEQ ID No.1461、SEQ ID No.1464、SEQ ID No.1465、SEQ ID No.1468、SEQ ID No.1472、SEQ ID No.1475、SEQ ID No.1477、SEQ ID No.1478、SEQ ID No.1480、SEQ ID No.1483、SEQ ID No.1484、SEQ ID No.1485、SEQ ID No.1486、SEQ ID No.1487、SEQ ID No.1490、SEQ ID No.1493、SEQ ID No.1494、SEQ ID No.1495、SEQ ID No.1496、SEQ ID No.1498、SEQ ID No.1499、SEQ ID No.1501、SEQ ID No.1502、SEQ ID No.1503、SEQ ID No.1504、SEQ ID No.1505、SEQ ID No.1506、SEQ ID No.1507、SEQ ID No.1508、SEQ ID No.1509、SEQ ID No.1510、SEQ ID No.1511、SEQ ID No.1512、SEQ ID No.1513、SEQ ID No.1514、SEQ ID No.1515、SEQ ID No.1517、SEQ ID No.1518、SEQ ID No.1520、SEQ ID No.1521、SEQ ID No.1524、SEQ ID No.1525、SEQ ID No.1526、SEQ ID No.1527、SEQ ID No.1528、SEQ ID No.1529、SEQ ID No.1531、SEQ ID No.1532、SEQ ID No.1533、SEQ ID No.1534、SEQ ID No.1535、SEQ ID No.1536、SEQ ID No.1537、SEQ ID No.1538、SEQ ID No.1539、SEQ ID No.1540、SEQ ID No.1541、SEQ ID No.1543、SEQ ID No.1544、SEQ ID No.1545、SEQ ID No.1546、SEQ ID No.1547、SEQ ID No.1548、SEQ ID No.1550、SEQ ID No.1551、SEQ ID No.1552、SEQ ID No.1553、SEQ ID No.1554、SEQ ID No.1555、SEQ ID No.1556、SEQ ID No.1557、SEQ ID No.1558、SEQ ID No.1559、SEQ ID No.1561、SEQ ID No.1562、SEQ ID No.1563、SEQ ID No.1564、SEQ ID No.1565、SEQ ID No.1567、SEQ ID No.1568、SEQ ID No.1569、SEQ ID No.1570、SEQ ID No.1571、SEQ ID No.1572、SEQ ID No.1573、SEQ ID No.1576、SEQ ID No.1579、SEQ ID No.1580、SEQ ID No.1582、SEQ ID No.1583、SEQ ID No.1584、SEQ ID No.1585、SEQ ID No.1586、SEQ ID No.1587、SEQ ID No.1588、SEQ ID No.1589、SEQ ID No.1590、SEQ ID No.1591、SEQ ID No.1592、SEQ ID No.1593、SEQ ID No.1594、SEQ ID No.1595、SEQ ID No.1596、SEQ ID No.1598、SEQ ID No.1599、SEQ ID No.1600、SEQ ID No.1602、SEQ ID No.1603、SEQ ID No.1604、SEQ ID No.1605、SEQ ID No.1606、SEQ ID No.1607、SEQ ID No.1608、SEQ ID No.1609、SEQ ID No.1611、SEQ ID No.1612、SEQ ID No.1613、SEQ ID No.1614、SEQ ID No.1615、SEQ ID No.1616、SEQ ID No.1617、SEQ ID No.1618、SEQ ID No.1619、SEQ ID No.1620、SEQ ID No.1623、SEQ ID No.1624、SEQ ID No.1625、SEQ ID No.1626、SEQ ID No.1627、SEQ ID No.1629、SEQ ID No.1632、SEQ ID No.1633、SEQ ID No.1634、SEQ ID No.1635、SEQ ID No.1636、SEQ ID No.1637、SEQ ID No.1638、SEQ ID No.1639、SEQ ID No.1640、SEQ ID No.1641、SEQ ID No.1642、SEQ ID No.1643、SEQ ID No.1644、SEQ ID No.1645、SEQ ID No.1646、SEQ ID No.1647、SEQ ID No.1648、SEQ ID No.1649、SEQ ID No.1650、SEQ ID No.1651、SEQ ID No.1652、SEQ ID No.1653、SEQ ID No.1654、SEQ ID No.1655、SEQ ID No.1656、SEQ ID No.1657、SEQ ID No.1658、SEQ ID No.1659、SEQ ID No.1660、SEQ ID No.1661、SEQ ID No.1662、SEQ ID No.1663、SEQ ID No.1664、SEQ ID No.1665、SEQ ID No.1666、SEQ ID No.1667、SEQ ID No.1668、SEQ ID No.1670、SEQ ID No.1671、SEQ ID No.1672、SEQ ID No.1678、SEQ ID No.1679、SEQ ID No.1680、SEQ ID No.1681、SEQ ID No.1686、SEQ ID No.1688、SEQ ID No.1690、SEQ ID No.1693、SEQ ID No.1694、SEQ ID No.1695、SEQ ID No.1696、SEQ ID No.1697、SEQ ID No.1698、SEQ ID No.1699、SEQ ID No.1700、SEQ ID No.1701、SEQ ID No.1702、SEQ ID No.1703、SEQ ID No.1704、SEQ ID No.1705、SEQ ID No.1706、SEQ ID No.1707、SEQ ID No.1708、SEQ ID No.1709、SEQ ID No.1711、SEQ ID No.1712、SEQ ID No.1713、SEQ ID No.1714、SEQ ID No.1716、SEQ ID No.1719、SEQ ID No.1720、SEQ ID No.1721、SEQ ID No.1722、SEQ ID No.1725、SEQ ID No.1726、SEQ ID No.1728、SEQ ID No.1730、SEQ ID No.1731、SEQ ID No.1732、SEQ ID No.1733、SEQ ID No.1734、SEQ ID No.1735、SEQ ID No.1736、SEQ ID No.1737、SEQ ID No.1738、SEQ ID No.1739、SEQ ID No.1740、SEQ ID No.1741、SEQ ID No.1742、SEQ ID No.1743、SEQ ID No.1744、SEQ ID No.1748、SEQ ID No.1750、SEQ ID No.1751、SEQ ID No.1752、SEQ ID No.1753、SEQ ID No.1754、SEQ ID No.1755、SEQ ID No.1756、SEQ ID No.1758、SEQ ID No.1759、SEQ ID No.1761、SEQ ID No.1762、SEQ ID No.1763、SEQ ID No.1766、SEQ ID No.1767、SEQ ID No.1769、SEQ ID No.1770、SEQ ID No.1771、SEQ ID No.1772、SEQ ID No.1773、SEQ ID No.1776、SEQ ID No.1777、SEQ ID No.1778、SEQ ID No.1780、SEQ ID No.1782、SEQ ID No.1783、SEQ ID No.1784、SEQ ID No.1785、SEQ ID No.1786、SEQ ID No.1788、SEQ ID No.1789、SEQ ID No.1792、SEQ ID No.1794、SEQ ID No.1799、SEQ ID No.1800、SEQ ID No.1802、SEQ ID No.1803、SEQ ID No.1804、SEQ ID No.1806、SEQ ID No.1807、SEQ ID No.1808、SEQ ID No.1810、SEQ ID No.1811、SEQ ID No.1812、SEQ ID No.1816、SEQ ID No.1817、SEQ ID No.1818、SEQ ID No.1820、SEQ ID No.1821、SEQ ID No.1822、SEQ ID No.1825、SEQ ID No.1826、SEQ ID No.1827、SEQ ID No.1828、SEQ ID No.1829、SEQ ID No.1830、SEQ ID No.1831、SEQ ID No.1832、SEQ ID No.1833、SEQ ID No.1834、SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2161、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2163、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2168、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽的OXA肽。
34. 权利要求33的检测方法,其中所述OXA肽选自序列为SEQ ID No.2160、SEQ ID No.2162、SEQ ID No.2164、SEQ ID No.2165、SEQ ID No.2166、SEQ ID No.2167、SEQ ID No.2169、SEQ ID No.2170、SEQ ID No.2171的肽。
35. 权利要求1-6中任一项的检测方法,其中所述抗性标记进一步包括选自序列为SEQ ID No.2132、SEQ ID No.2134到SEQ ID No.2138、SEQ ID No.2141到SEQ ID No.2155和SEQ ID No.2157到SEQ ID No.2159的肽的GES肽。 ”
复审请求人认为:(1)修改后的权利要求1与对比文件1的区别至少在于限定了具体的用于检测的TEM肽序列。本申请证明了这些肽可以用于质谱检测。本发明实际解决的技术问题至少是提供可以用于头孢菌素抗性标记的质谱检测的肽。(2)证据1公开了TEM在抗生素抗性中的作用,并且公开了不同的超广谱β-内酰胺酶具有不同的质谱特征片段肽,但是根据复审通知书中所复述的证据1的内容,其仅涉及不同TEM蛋白之间的个别位点的氨基酸差异,而并没有提及选择何种序列的TEM肽进行质谱检测。(3)如对比文件2所教导的,对于同一种蛋白质,其质谱检测和定量是肽依赖性的。选择TEM蛋白进行检测,不意味着可以容易地找到可以在质谱检测中提供可靠的信号的合适的TEM肽。实际上,仅通过计算机分析或根据证据l的内容不可能确定哪些肽适合作为质谱检测的标记,哪些肽不适合。(4)本发明的涉及具体TEM肽序列的方法具备创造性,因此,权利要求6的各技术方案之间具有相同的对现有技术作出贡献的特定技术特征,它们之间具备单一性。同理,权利要求7-35也具备单一性。
在上述程序的基础上,合议组认为本案事实已经清楚,可以作出审查决定。
二、决定的理由
1、审查文本的认定
复审请求人于2019年05月27日在答复复审通知书时提交了权利要求书的替换文本,经审查,该修改符合专利法第33条和专利法实施细则第61条第1款的规定。因此,本复审请求审查决定所针对的审查文本如下:国际申请进入中国国家阶段的递交日2013年12月19日提交的说明书摘要;2017年09月22日提交的说明书第1-2535段;以及2019年05月27日提交的权利要求第1-35项。
2、关于专利法第22条第3款
专利法第22条第3款规定:创造性,是指与现有技术相比,该发明具有突出的实质性特点和显著的进步。
评价一项发明是否具备创造性时,应将其与最接近的现有技术比较以确定区别特征和实际解决的技术问题,然后考察现有技术整体上是否给出了将上述区别特征应用到该最接近的现有技术以解决其存在的技术问题的启示,如果现有技术中存在这种启示,则该发明是显而易见的,不具备创造性。
本案中,权利要求1请求保护“一种通过多反应监测模式的MS/MS类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于:a)抗菌剂是头孢菌素;以及b)所述抗性标记包括选自序列为SEQ ID No.166到SEQ ID No.218、SEQ ID No.220到SEQ ID No.230、SEQ ID No.232到SEQ ID No.241、SEQ ID No.243到SEQ ID No.252、SEQ ID No.254到SEQ ID No.257、SEQ ID No.259到SEQ ID No.261、SEQ ID No.1923、SEQ ID No.1927和SEQ ID No.1928的肽的TEM肽”。
对比文件1(Ingrid.Wybo等,Differentiation of cfiA-Negative and cfiA-Positive Bacteroides fragilis Isolates by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry,JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY,第49卷,第5期,第1961-1964页,公开日2011年02月23日)公开了利用MALDI-TOF质谱来区分cfiA阳性和cfiA阴性的脆弱拟杆菌分离株(参见其标题);其中具体公开了脆弱拟杆菌的碳青霉烯抗性与cfiA基因编码的B类金属型β内酰胺酶相关(参见其1961页左栏第1段);利用质谱可以区分cfiA阳性株和cfiA阴性株进而可以确定脆弱拟杆菌菌株对碳青霉烯的潜在抗性;所述两种不同基因型群体的蛋白图谱差异约为10个峰(参见其第1963页左栏第2段);由于cfiA基因存在沉默而可能获得假阳性,将cfiA阳性株引入MALDI-TOF MS用于鉴定并利用质谱数据作为碳青霉烯抗性检测的替代标记,将是有利的;以及由于MALDI-TOF MS分析可以在少于10min内进行,而疑似感染的常规检测需要花费额外的48h,因此其也可以用于指导脆弱拟杆菌感染的经验性处理等(参见其第1963页右栏第1段)。由此可见,对比文件1公开了利用MALDI-TOF质谱检测样品中脆弱拟杆菌的抗性标记的方法,其中所述抗性标记为cfiA基因编码蛋白(即B类金属型β-内酰胺酶)以及其相对应的抗菌剂抗性为碳青霉烯。
权利要求1与对比文件1的区别在于:(1)其采用的质谱类型为多反应监测模式的MS/MS;(2)其所针对的抗性标记涉及TEM型β-内酰胺酶的具体肽段以及其相对应的抗菌剂抗性为头孢菌素。权利要求1相对于对比文件1实际解决的技术问题在于:其提供了利用质谱进行β-内酰胺酶抗性标记的类似检测方法。
对于区别特征(1),对比文件2(Hasmik Keshishian等,Quantitative, Multiplexed Assays for Low Abundance Proteins in Plasma by Targeted Mass Spectrometry and Stable Isotope Dilution,Mol Cell Proteomics,第6卷,第12期,第2212-2229页,公开日2007年12月31日)公开了利用靶向质谱和稳定的同位素稀释(SID)技术来多重定量检测血浆中的低丰度蛋白(参见其标题);其中具体公开了多反应监测模式的串联质谱类型的质谱(MRM LC-MS/MS)与SID联合可用于直接定量血浆中的蛋白(参见其第2213页末段、倒数第2段);以及所述包含蛋白的血浆样品被胰蛋白酶消化(参见其第2214页末段)。由此可见,对比文件2已经公开了利用多反应监测模式的MS/MS类型的质谱能够有效检测目标蛋白。因此,针对目标蛋白进行检测,本领域技术人员将会有动机在多种质谱检测方法中选择相对合适的一种具体质谱检测方法来进行。
对于区别特征(2),《β-内酰胺酶与细菌耐药》(李金钟等.河北科学技术出版社.2007年)公开了β-内酰胺酶的TEM-1、TEM-2基因型可以水解三代头孢菌素或氨曲南(参见其第28页第2段),TEM-7、TEM-12基因型可以水解头孢他啶(参见其第28页第4段),TEM-3基因型(即CTX-1基因型)对头孢噻肟耐药(参见其第29页末段),TEM-5、TEM-8、TEM-11、TEM-16、TEM-24、TEM-46、TEM-61、TEM-91和TEM-144基因型可以水解头孢他啶(参见其第32页首段),TEM-50、TEM-68、TEM-89、TEM-109、TEM-121和TEM-125基因型对三代头孢菌素耐药(参见其第32页第2段),TEM-3、TEM-4基因型对头孢他啶、头孢曲松、头孢噻肟和氨曲南耐药(参见其第32页末段),TEM-10基因型可以水解头孢他啶、氨曲南、哌拉西林和羧苄西林(参见其第32页末段),以及TEM-134、TEM-138基因型可以水解头孢噻肟和头孢他啶(参见其第33页首段)等。由此可见,TEM型β-内酰胺酶与其相对应的头孢菌素抗性之间存在着某种关联性,这属于本领域的公知常识。因此,无论是对比文件1中公开的金属型β-内酰胺酶及其相关的碳青霉烯抗性,还是权利要求1中限定的TEM型β-内酰胺酶及其相关的头孢菌素抗性,它们均是本领域各种不同基因型β-内酰胺酶与其相对应抗性之间具有关联性的相关具体情形。此外,《β-内酰胺酶与细菌耐药》还公开了TEM-2与TEM-1相比在39位点发生了赖氨酸替换丝氨酸的突变(Ser39Lys),但其底物轮廓没有变化;TEM-13与TEM-2相比在265位点上由蛋氨酸替换酪氨酸(Tyr265Met),该位点的突变并未影响酶的活性和底物轮廓(参见其第29页末段);TEM-3型是第一个具有超广谱特征的TEM型β-内酰胺酶,它与TEM-1比较,有3个位点的氨基酸替换,即Glu39Lys、Glu104Lys、Gly238Ser,后两个位点氨基酸的突变赋予了有效水解超广谱头孢菌素的特征;TEM-10与TEM-1比较,发生了Arg164Ser和Glu240Ser的氨基酸替换;TEM-63与TEM-1比较,有4个氨基酸的替换(Leu21Phe、Glu104Lys、Arg164Ser和Met182Thr);TEM-131与TEM-1比较,除了上述4个氨基酸的替换以外(Leu21Phe、Glu104Lys、Arg164Ser和Met182Thr)还存在Ala237Thr的替换;TEM-132与TEM-1的不同是有3个氨基酸的替换(Arg164His、Ile173Val和Glu240Lys);TEM-134与TEM-1比较,存在Glu39Lys、Glu104Lys、Arg164His和Gly238Ser 4个位点的突变;TEM-138与TEM-1的不同是有3个位点突变(Glu104Lys、Asn175Ile和Gly238Ser);TEM-144与TEM-1比较有2个突变位点(Arg164Cys和Glu240Lys);TEM-91与TEM-1比较仅有1个位点的氨基酸替换(Thr182Met);TEM-151/ TEM-152与TEM-1的差异是均存在Arg164His、Met69Val、Asn276Asp的替换,其中TEM-151另有Ala284Gly突变,而TEM-152另有Glu240Lys突变;以及TEM β-内酰胺酶的氨基酸替换可导致β-内酰胺酶的水解底物谱的改变,其中部分位点的氨基酸替换对产生超广谱表型(即ESBL)起到了非常重要的作用,如Glu104Lys、Arg164His、Gly238Ser、Glu240Lys等,尤其是Gly238Ser、Glu240Lys两个位点的突变,分别是对头孢噻肟和头孢他啶耐药的关键突变位点。TEM型ESBLs的氨基酸替换见图2-2-1(参见其第32页末段至第33页第3段)等。由此可见,不同的TEM型β-内酰胺酶具有不同的质谱特征片段肽,也已经被上述公知常识所实质公开或者存在相关技术启示。
总之,根据蛋白质谱的检测原理,选择何种序列的TEM肽进行质谱检测,与所选择酶切消化的具体蛋白酶有关(例如胰蛋白酶);而《β-内酰胺酶与细菌耐药》中所公开的不同TEM蛋白之间的个别位点的氨基酸差异,其则是所述肽段是否可以作为相关抗性标记的关键考虑因素。因此综上,从对比文件1出发,在对比文件1公开了利用MALDI-TOF质谱进行金属型β-内酰胺酶检测、进而进行碳青霉烯抗性预测该公开内容的基础上,本领域技术人员结合对比文件2和公知常识,将会有动机选择相对合适的MS/MS质谱类型作为替换手段,并且有动机将所述方法转用于本领域公知的TEM型β-内酰胺酶检测及其相应的头孢菌素抗性预测,利用本领域普通技术知识和常规实验便可以获得权利要求1所述的具体技术方案。因此综上,权利要求1请求保护的技术方案,在对比文件1结合对比文件2和公知常识的教导下是显而易见的,其不具备专利法第22条第3款规定的创造性。
权利要求2进一步限定了“所述抗性标记是来源于所述至少一种微生物的蛋白质”。 《β-内酰胺酶与细菌耐药》还公开了TEM型β-内酰胺酶主要由大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌产生,但也见于枸橼酸杆菌、沙雷菌、变形杆菌、沙门菌、阴沟肠杆菌等肠杆菌科细菌以及铜绿假单胞菌等(参见其第33页末段),并且隐含公开了TEM型β-内酰胺酶属于蛋白质(参见其第33页第3段)。由此可见,权利要求2的附加技术特征已经被上述公知常识所实质公开。因此,在其引用的权利要求不具备创造性的基础上,权利要求2请求保护的技术方案仍然是显而易见的,其不具备专利法第22条第3款规定的创造性。
权利要求3-5分别限定了“来源于所述微生物的蛋白质被消化成肽”、“用酶进行所述消化”、以及“所述酶是胰蛋白酶”。对比文件2还公开了包含蛋白的血浆样品被胰蛋白酶消化(参见其第2214页末段)。由此可见,权利要求3-5的附加技术特征已经被实质公开。因此,在其引用的权利要求不具备创造性的基础上,权利要求3-5请求保护的技术方案仍然是显而易见的,其不具备专利法第22条第3款规定的创造性。
权利要求6进一步限定了“所述抗性标记进一步包括CMY、CTX-M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA或GES蛋白或肽”。《β-内酰胺酶与细菌耐药》还公开了β-内酰胺酶的SHV-1基因型可以水解三代头孢菌素或氨曲南(参见其第28页第2段),SME-1基因型可以水解碳青霉烯(参见其第28页倒数第2段),以及PER基因型、VEB基因型、LTA-1基因型、GES/IBC基因型可以水解头孢他啶,SFO-1基因型、BES-1基因型、CTX-M基因型可以水解头孢噻肟(参见其第27页末段至第28页首段)等。由此可见,所述抗性标记进一步包括CTX-M、SHV、PER、VEB或GES的β-内酰胺酶基因型蛋白也已经被上述公知常识所实质公开。因此,在其引用的权利要求不具备创造性的基础上,权利要求6请求保护的技术方案仍然是显而易见的,其不具备专利法第22条第3款规定的创造性。
权利要求7-8分别限定了所述TEM抗性标记的质谱特征片段肽,ESBL抗性标记的质谱特征片段肽。《β-内酰胺酶与细菌耐药》还公开了TEM-2与TEM-1相比在39位点发生了赖氨酸替换丝氨酸的突变(Ser39Lys),但其底物轮廓没有变化;TEM-13与TEM-2相比在265位点上由蛋氨酸替换酪氨酸(Tyr265Met),该位点的突变并未影响酶的活性和底物轮廓(参见其第29页末段);TEM-3型是第一个具有超广谱特征的TEM型β-内酰胺酶,它与TEM-1比较,有3个位点的氨基酸替换,即Glu39Lys、Glu104Lys、Gly238Ser,后两个位点氨基酸的突变赋予了有效水解超广谱头孢菌素的特征;TEM-10与TEM-1比较,发生了Arg164Ser和Glu240Ser的氨基酸替换;TEM-63与TEM-1比较,有4个氨基酸的替换(Leu21Phe、Glu104Lys、Arg164Ser和Met182Thr);TEM-131与TEM-1比较,除了上述4个氨基酸的替换以外(Leu21Phe、Glu104Lys、Arg164Ser和Met182Thr)还存在Ala237Thr的替换;TEM-132与TEM-1的不同是有3个氨基酸的替换(Arg164His、Ile173Val和Glu240Lys);TEM-134与TEM-1比较,存在Glu39Lys、Glu104Lys、Arg164His和Gly238Ser 4个位点的突变;TEM-138与TEM-1的不同是有3个位点突变(Glu104Lys、Asn175Ile和Gly238Ser);TEM-144与TEM-1比较有2个突变位点(Arg164Cys和Glu240Lys);TEM-91与TEM-1比较仅有1个位点的氨基酸替换(Thr182Met);TEM-151/ TEM-152与TEM-1的差异是均存在Arg164His、Met69Val、Asn276Asp的替换,其中TEM-151另有Ala284Gly突变,而TEM-152另有Glu240Lys突变;以及TEM β-内酰胺酶的氨基酸替换可导致β-内酰胺酶的水解底物谱的改变,其中部分位点的氨基酸替换对产生超广谱表型(即ESBL)起到了非常重要的作用,如Glu104Lys、Arg164His、Gly238Ser、Glu240Lys等,尤其是Gly238Ser、Glu240Lys两个位点的突变,分别是对头孢噻肟和头孢他啶耐药的关键突变位点。TEM型ESBLs的氨基酸替换见图2-2-1(参见其第32页末段至第33页第3段)等。由此可见,不同的TEM型β-内酰胺酶具有不同的质谱特征片段肽,以及不同的超广谱β-内酰胺酶(ESBL)具有不同的质谱特征片段肽,也都已经被上述公知常识所实质公开或者存在相关技术启示。因此,在其引用的权利要求不具备创造性的基础上,权利要求7-8请求保护的技术方案仍然是显而易见的,其不具备专利法第22条第3款规定的创造性。
3、关于专利法第31条第1款
专利法第31条第1款规定:一件发明专利申请应当限于一项发明,属于一个总的发明构思的两项以上的发明,可以作为一件申请提出。
如果多项发明之间不包含相同或相应的对现有技术作出贡献的特定技术特征,则该多项发明之间不属于一个总的发明构思而不具备单一性。
本案中,权利要求1请求保护“一种通过多反应监测模式的MS/MS类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于: a)抗菌剂是头孢菌素;以及 b)所述抗性标记包括选自序列为SEQ ID No.166到SEQ ID No.218、SEQ ID No.220到SEQ ID No.230、SEQ ID No.232到SEQ ID No.241、SEQ ID No.243到SEQ ID No.252、SEQ ID No.254到SEQ ID No.257、SEQ ID No.259到SEQ ID No.261、SEQ ID No.1923、SEQ ID No.1927和SEQ ID No.1928的肽的TEM肽”。权利要求1所述抗性标记选自各种TEM肽段的各技术方案之间,它们的相同或相应的技术特征为:一种通过多反应监测模式的MS/MS类型的质谱检测样品中至少一种微生物针对至少一种抗菌剂的至少一种抗性标记的方法,其特征在于:a)抗菌剂是头孢菌素;以及b)所述抗性标记包括选自TEM肽。如上所述,所述TEM抗性标记与其头孢菌素抗性之间具有关联性的质谱检测相关技术方案,在对比文件1、对比文件2和公知常识的教导下不具备创造性。在此基础上,权利要求1所述抗性标记选自各种TEM肽段的不同质谱特征片段肽序列的各技术方案之间,不包含相同或相应的对现有技术作出贡献的特定技术特征,因此该各技术方案之间不具备单一性,不符合专利法第31条第1款的规定。
4、对复审请求人相关意见的评述
对于复审请求人的陈述意见,合议组认为:(1)蛋白质谱的基本检测原理是,将蛋白质酶切消化为肽段混合物,然后肽段混合物被电离形成带电离子,最后分析每个肽段的质荷比(M/Z),从而获得所有肽段的M/Z图谱,即该蛋白质的一级质谱峰图;利用串联质谱可以对肽段离子进行二级质谱分析,从而获得选取肽段的二级质谱峰图;根据所述一级质谱峰图和二级质谱峰图来鉴定所述蛋白质(例如与所述蛋白质的理论质谱峰图进行比对)。而所述肽段是否可以作为抗性标记,则被证据1实质公开了或者给出了技术启示。具体而言,证据1公开了TEM β-内酰胺酶的氨基酸替换可导致β-内酰胺酶的水解底物谱的改变,其中部分位点的氨基酸替换对产生超广谱表型(即ESBL)起到了非常重要的作用,如Glu104Lys、Arg164His、Gly238Ser、Glu240Lys等,尤其是Gly238Ser、Glu240Lys两个位点的突变,分别是对头孢噻肟和头孢他啶耐药的关键突变位点等等。(2)如上所述,根据蛋白质谱的检测原理,选择何种序列的TEM肽进行质谱检测,与所选择酶切消化的具体蛋白酶有关(例如胰蛋白酶),而该附加技术特征已经被对比文件2所实质公开了。至于证据1所公开的不同TEM蛋白之间的个别位点的氨基酸差异,其则是所述肽段是否可以作为抗性标记的关键考虑因素。(3)如上所述,对比文件1公开并验证了通过质谱检测cfiA基因编码的B类金属型β-内酰胺酶、进而对碳青霉烯抗性进行预测的该技术思路,而不同基因型β-内酰胺酶与其相对应的抗菌剂抗性之间存在着某种关联性则属于本领域公知常识的相关内容(参见例如TEM型β-内酰胺酶. 李金钟等.《β-内酰胺酶与细菌耐药》.河北科学技术出版社.2007年;金属型β-内酰胺酶. 任南主编. 《实用医院感染监测方法与技术》.湖南科技出版社.2007年),至于如何选择相对合适的具体质谱检测方法以及所述肽段的具体形成过程,则在对比文件2中给出了相关技术启示。因此,所述TEM肽段的选择,在对比文件1、对比文件2和公知常识的教导下利用本领域技术人员的普通技术知识和常规实验便可以获得。(4)如上所述,修改后的权利要求1所述抗性标记选自各种TEM肽段的各技术方案之间,仍然不具有相同或相应的特定技术特征,因此仍然不具备单一性。因此,复审请求人认为本申请具备创造性和单一性的理由不能成立。
基于上述事实和理由,本案合议组作出如下复审请求审查决定。
三、决定
维持国家知识产权局于2017年06月08日对本申请作出的驳回决定。
如对本复审请求审查决定不服,根据专利法第41条第2款的规定,复审请求人可以自收到本决定之日起三个月内向北京知识产权法院起诉。
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